Кристобаль Баленсиага Эйсагирре родился 21 января 1895 года в баскском городе Гетария на берегу Бискайского залива. Дизайнер не любил распространяться о себе и своей личной жизни, поэтому все его биографии собраны со слов его близких друзей, коллег и клиентов.
Кристобаль родился в скромной семье рыбака и швеи. Его отец, Хосе Баленсиага Басурто, умер от кровоизлияния в мозг, когда дизайнеру было 11 лет.
Мальчик стал много времени проводить с матерью, Мартиной Эйсагирре, и помогал ей, когда она устроилась на работу швеей, чтобы содержать семью.
У Кристобаля была сестра Мария Августина и младший брат Хуан Мартин. Семья для Баленсиаги была самым главным, он старался помогать им на протяжении всей жизни.