Летние сорта яблок хранятся от двух недель до полутора месяцев. Осенние сорта лежат до начала декабря. Долго остаются свежими зимние сорта.
Позднезимние сорта хранятся до апреля — мая. После сбора яблоки могут пострадать от инфекций, а также от болезней, вызванных неблагоприятными условиями хранения.
Плодовая гниль чаще всего наносит урон урожаю. Возбудители проникают в плоды через травмированную кожицу. Иногда садоводы при съёме повреждают яблоки, слегка царапая ногтями или травмируя их ветками.